文章目录

0 引言

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

1.2 方法

    1.2.1 水稻DUF642家族基因的鉴定及理化分析

    1.2.2 水稻DUF642家族系统进化树构建

    1.2.3 水稻DUF642家族染色体定位及基因和蛋白质结构分析

    1.2.4 水稻DUF642启动子顺式元件(cis-element)分析

    1.2.5 水稻DUF642基因响应胁迫诱导的表达模式分析

2 结果与分析

2.1 水稻DUF642家族鉴定及基因特征

2.2 水稻、拟南芥和玉米DUF642基因家族系统进化树构建

2.3 水稻 DUF642 基因的染色体定位

2.4 水稻 DUF642 家族基因和蛋白结构分析

2.5 水稻DUF642家族启动子区域分析

2.6 水稻DUF642基因非生物逆境诱导表达模式分析

3 讨论与结论

文章摘要:DUF（domain of unknown function）家族,是指含有未知功能域的蛋白质家族,在植物生命活动中发挥着重要的调控作用. DUF642是其中一个高度保守的植物特异性的未知细胞壁相关蛋白家族,参与调控植物的生长发育以及逆境响应.在水稻全基因组内对DUF642家族成员进行了鉴定,并对其染色体定位、进化关系、基因结构、蛋白结构和启动子顺式作用元件等进行了系统的分析.结果显示,水稻DUF642基因家族有6个成员,分布在1号、3号、4号、7号染色体上.系统发育进化树分析可将6个水稻DUF642蛋白分为3个亚组,基因结构和蛋白结构保守基序分析都表明水稻DUF642家族成员在进化上具有较高的保守性.启动子顺式作用元件预测以及非生物逆境诱导表达模式分析表明,OsDUF642家族基因在水稻响应非生物逆境胁迫中具有重要作用.以上结果加深了对植物DUF642基因家族的认识,并为进一步阐明OsDUF642基因家族成员在水稻抵御非生物逆境中的生物学功能提供了参考依据.

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